Table of Contents - bio-faidx-0.0.1 Documentation
Pages
Classes and Modules
- Bio
- Bio::DB
- Bio::DB::Faidx
- Bio::DB::Faidx::Bio
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta
- Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta::Region
- Bio::DB::Faidx::Entry
- Bio::DB::Fasta
- Bio::DB::Fasta::Region
Methods
- ::new — Bio::DB::Faidx
- #[] — Bio::DB::Faidx
- #each_entry — Bio::DB::Faidx
- #entries — Bio::DB::Faidx
- #entries_order — Bio::DB::Faidx
- #init_cache — Bio::DB::Faidx
- #joinRegion — Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta::Region
- #joinRegion — Bio::DB::Fasta::Region
- #overlap_in_set — Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta::Region
- #overlap_in_set — Bio::DB::Fasta::Region
- #overlaps — Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta::Region
- #overlaps — Bio::DB::Fasta::Region
- #read_entries — Bio::DB::Faidx
- #subset — Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Faidx::Bio::DB::Fasta::Region
- #subset — Bio::DB::Fasta::Region